瑜伽是否适合穆斯林进行，关键并不在于伸展、盘腿或呼吸训练这些动作本身，而是相关练习是否夹带宗教仪式、咒语、崇拜或其他与伊斯兰信仰不一致的元素。
马来西亚全国回教事务理事会法特瓦委员会早在2008年10月22日至24日举行的第83次会议中，就曾讨论穆斯林进行瑜伽的问题，并针对其中涉及宗教及灵性元素的部分作出裁决。
当时会议认为，瑜伽源自印度教传统，部分流派并非单纯运动，而是把身体动作与宗教修习、咒语、崇拜及追求灵性结合，甚至涉及通过练习达到与神合一等目标，因此有关形式并不适合穆斯林进行，也可能影响伊斯兰信仰。
换言之，被禁止的并不是“运动”本身，而是瑜伽练习中若同时包含其他宗教信仰内容，才会构成主要问题。
其中一个受到关注的部分是“咒语”。部分瑜伽练习除了身体动作，也会要求参与者念诵带有印度教宗教背景的特定词句。这类宗教性念诵，被认为与单纯健身性质不同。
另一个关键问题是崇拜行为。如果课程过程中出现向真主以外对象进行膜拜、祈求或宗教仪式，从伊斯兰信仰角度而言，就会与独一神信仰原则产生冲突。
部分瑜伽流派也包含“人与神合一”等灵性观念。法特瓦讨论认为，这类哲学和精神追求涉及信仰层面，因此不只是一般身体训练。
联邦直辖区宗教司署过去也曾解释，瑜伽拥有不同体系，例如Karma Yoga、Raja Yoga、Bhakti Yoga及Jnana Yoga等，其中部分流派与印度教哲学及宗教传统有密切关系。
不过，有关裁决同时区分了宗教性瑜伽与单纯身体运动。
若一个人只是进行伸展、柔软度训练、呼吸练习、肌肉强化或为了改善背痛而进行类似动作，而且目的纯粹是健康及健身，没有涉及咒语、宗教仪式、崇拜或其他宗教信念，则一般并不会因为动作本身而被视为违规。
因此，穆斯林若参加所谓瑜伽课程，重点不应只看课程名称，而是必须了解课程实际内容，尤其是否包含宗教念诵、灵性仪式或其他信仰元素。
有关宗教机构也提醒穆斯林，在参与任何身心训练时应保持谨慎，避免在不知情下接触可能影响信仰的宗教性内容。
