若咖啡是每日的“醒脑仪式”，那就更该聪明地喝。《华盛顿邮报》引述哈佛大学医学院研究员特丽莎·帕理帢（Tricia Psota）的分析指出，依据多项研究结果，中午前喝咖啡的人，整体死亡风险比整天喝咖啡（尤其是下午或晚上）的人低约16%；相反，未经过滤的咖啡则与较高的死亡率相关。
帕理帢建议，若要在享受风味的同时兼顾健康，每杯咖啡加糖不应超过1茶匙，加全脂牛奶不超过2汤匙；每日摄取约3.5杯滤泡咖啡，是最理想的健康量。
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2022年的一项研究也发现，喝无糖咖啡的人死亡风险最低，即使每日饮用超过4.5杯仍与较长寿命相关；若只加少量（1茶匙）糖，也能维持咖啡的健康益处。世界卫生组织（WHO）建议每日糖摄取上限为女性6茶匙、男性9茶匙。
除了“怎么喝”，“何时喝”也影响健康。对逾4万名美国人的调查显示，中午前喝咖啡者的死亡风险最低。科学家解释，下午或夜晚喝咖啡会干扰睡眠品质；研究发现，午后摄入过多咖啡因会抑制约30%的褪黑激素分泌，长期扰乱生理时钟，可能引发体内慢性发炎与免疫功能失调。
若偏好即溶咖啡或低咖啡因咖啡，也不必担心。研究指出，这些版本与研磨咖啡的健康效果几乎无异。
不过，冲煮方式才是真正关键。2020年针对50万名挪威人的研究显示，法式滤压壶与传统义式浓缩咖啡因“未过滤”而与较高死亡率有关。另一研究也发现，每天饮用3至5杯浓缩咖啡或6杯以上法式滤压咖啡的人，其血清胆固醇水平明显偏高。
这是因为未过滤咖啡含有“双萜类”（diterpenes）化合物，会提升体内胆固醇、并降低肝脏清除低密度脂蛋白（LDL）的能力。而滤纸能有效阻隔这些物质，让咖啡更安全健康。
有趣的是，从制程角度来看，即溶咖啡与胶囊咖啡其实都属于“有过滤”类别，因此在健康风险上更接近滤泡咖啡。
